생쥐와 인간 다운로드
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생쥐와 인간 다운로드

100-종 보존 트랙과 같이 맞춤 트랙에 사용 되는 어셈블리의 시퀀스 파일은/gbdb 서버 에서도 찾을 수 있습니다. 예를 들면, 당신은 hg38 등뼈 동물에 사용 되는 얼룩말 mbuna 물고기 집합을 위한 근본적인 mayzeb 1.2 비트 순서 파일을 찾아낼 수 있다 정렬 및 보존 (100 종) 궤도 그러나 독립 브라우저로 여기에서 아직 풀어 놓이 지 않는다: http:// hgdownload.soe.ucsc.edu/gbdb/mayZeb1/. 이러한 바이너리 파일에서 개별 지역 또는 전체 게놈 주석은 소스 코드에서 컴파일되거나 시스템에 대해 미리 컴파일된 바이너리로 다운로드 될 수 있는 bigbedtobed와 같은 도구를 사용 하 여 얻을 수 있습니다 (소스 및 유틸리티 다운로드 섹션 참조). . bigbedtobed 도구는 주어진 범위 내에서 기능의 특정 하위 집합을 얻을 하는 데 사용할 수 있습니다, 예를 들면:. 체인 파일은 위의 해당 어셈블리 섹션에서 찾을 수 있습니다. 예를 들어 mm5 파일에 대 한 링크는 mm5 다운로드 섹션에 있습니다. 수명선 소스 다운로드 링크는 소스 및 유틸리티 다운로드 섹션에 있습니다. 유틸리티 디렉터리는 미리 컴파일된 독립 실행형 바이너리의 다운로드를 제공 합니다. 게놈 브라우저에 있는 모든 테이블은 다운로드 전화번호부에 있는 readme.txt 파일에서 나타난 대로를 제외 하 고 어떤 목적 든 지를 위해 자유롭게 쓸모 있다. 특정 데이터 집합과 관련 된 제한을 보려면 해당 다운로드 링크를 클릭 하 고 추가 정보 텍스트를 검토 합니다. 이러한 데이터는 많은 연구자, 게놈 브라우저 크레딧 페이지에 나와있는 기여 했다.

사용 하는 데이터의 기여자 (들)을 인정 하십시오. 다음 http://hgdownload.soe.ucsc.edu/gbdb/위치에는 100-종 보존 트랙과 같이 정렬 트랙에 사용 되는 어셈블리 시퀀스가 있습니다. 예를 들어, 당신은 얼룩말 mbuna 피쉬 어셈블리에 대 한 기본 mayzeb 1.2 비트 시퀀스 파일을 찾을 수 있습니다, 아직 발표 되지 않았지만, hg38 척추 multiz 정렬에 사용 되는 (100 종) 트랙, 여기: http://hgdownload.soe.ucsc.edu/gbdb/mayZeb1/. 이러한 링크는 보존 트랙 설명 페이지에서 “ucsc 버전” 이라는 제목의 열 아래에도 표시 됩니다. 느린 다운로드 속도에 문제가 발생 하면 긴 거리에서 대규모 데이터 전송 처리량을 향상 시키는 UDT 사용 Rsync (udr)를 사용해 보십시오. 32 비트 및 64 비트 버전은 여기에서 다운로드할 수 있습니다. 켄트 소스 트리에서 특정 디렉토리를 반입 또는 userapps 다운로드에 대 한 정보는 userapps README를 참조 하십시오. 모든 켄트 공용 품을 설치 하는 src. blat와에서 silco PCR 소프트웨어의 상업적인 다운로드 그리고 임명에는 켄트 정보학에서 얻어질 지도 모른다 면허를 요구 한다 유의 하십시오. 게놈 브라우저, blat, liftover 및 기타 유틸리티에 대 한 소스가 아닌 비영리 학술 연구 및 개인 사용을 위한 무료입니다. 상업용 라이선스에 대 한 자세한 내용은 게놈 브라우저 및 blat 라이선스 요구 사항을 참조 하십시오.

이러한 제품 중 몇 가지에 대 한 소스 및 실행 파일을 다운로드 하거나 온라인 상점에서 구입할 수 있습니다. 이 페이지는 ucsc 게놈 브라우저에 등장 하는 게놈 조립품의 시퀀스 및 주석 데이터 다운로드에 대 한 링크를 포함 합니다. 테이블 다운로드는 또한 게놈 브라우저 FTP 서버를 통해 유효 하다. 각 게놈의 최근 집합에 빠른 접근을 위해, 현재 게놈 전화번호부를 보십시오. 이 디렉터리는 항상 가장 최근의 어셈블리를 참조 해야 자동화 된 스크립트가 있는 개인에 게 유용할 수 있습니다.

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